巢湖臨床醫學院于2014年8月隨著學校臨床醫學院體制改革而正式設立，巢湖臨床醫學院是由巢湖臨床醫學院學生黨總支(在校本部)與安醫大附屬巢湖醫院(在巢湖)組成，是安徽醫科大學最有傳承、最具青春朝氣的學院之一，下轄精神醫學系、全科醫學系、醫學心理學系，開設臨床醫學（農村免費定向）專業、精神醫學專業。

　　巢湖臨床醫學院學生黨總支在安醫大校本部，主要承擔著學院臨床醫學（農村免費定向）專業、精神醫學專業兩個專業類型五年制本科生的日常管理和黨務、思想政治教育工作以及CSC留學生的教學管理工作。

　　黨總支目前有在編人員5人，專職輔導員2人、兼職輔導員2人、兼職班主任11人；現有在校生478人，其中臨床醫學（農村免費定向）257人、精神醫學專業209人、CSC留學生4屆12人。已有5屆322名臨床醫學專業學生順利畢業，順利進入臨床規范化培訓階段（首屆畢業生已走向工作崗位）。

　　學生在校期間獲得大學生互聯網+大學生創新創業大賽、大學生創新創業創新訓練計劃、大學生職業規劃設計大賽暨大學生創業大賽、安徽省百萬大學生百所高校創意創新大賽以及大學生“挑戰杯”課外科技作品和創業大賽等省級以上獎勵近20項。