工程審計學院是國內全日制高等教育唯一的工程審計類人才專業學院。其前身可以追溯到1988年南京審計學院財金系基本建設投資審計教研室，歷經國際審計學院、工程管理學院、信息工程學院(工程管理與審計學院掛靠)等名稱變化。1988年，我校為適應國家審計機關對同時兼備工程和財務知識的人才急需，開設基本建設審計專業。1993年，開設審計學本科專業(基建審計方向)。2002年，開設工程管理本科專業(工程審計方向)。2011年，我校成為全國首批審計碩士專業學位授權單位，當年開始招收公共工程審計方向的研究生。2021年，學院取得工程管理碩士(MEM)招生資格。

　　學院秉承“扎根工程、以審育人”院訓，彰顯工程審計特色，挖掘工程審計行業資源和優勢。深耕工程審計三十多年，已為全國審計機關和工程審計領域培養高層次專業人才數千名，在行業享有較高的知名度和影響力。

　　學院現有工程審計系、工程造價系2個系和江蘇省公共工程審計重點實驗室1個省級重點實驗室，開設工程審計、工程管理、工程造價3個本科專業，擁有審計專業碩士(MAud)(公共工程審計方向)學位授予權。

　　江蘇省公共工程審計重點實驗室是全國高校唯一省級以上的工程審計重點實驗室，工程管理專業是江蘇省一流本科專業建設點。

　　學院根據學科和專業高質量發展需要，擁有一支專兼結合的高素質師資團隊，為學院人才培養、專業教育和教學科研提供強有力的支撐。現有兼職教師10余人，覆蓋國家審計機關、企事業單位工程審計等相關方面的行業精英，擁有江蘇省產業教授2名，邀請行業專家參與人才培養、專業建設和課堂教學全過程。現有專任教師32人，其中教授6人，副教授12人，碩士生導師10余人，28人具有博士學位，博士占比達到90%。

　　學院與審計署、地方審計機關、雄安新區審計中心、中鐵建、中建、中核、江蘇希地豐華等單位保持密切的工作聯系，建有海信集團、中國聯合等研究生工作站。每年與審計署投資司聯合舉辦全國工程審計年會，打造全國工程審計理論與實務研究高地。

　　學院現有在校生800余名。專業具有顯著的比較優勢，專業門檻高、就業面廣、適應性強。社會需求長期供不應求，畢業生就業率和就業質量歷年來一直高居全校前列，擁有良好的社會聲譽。

　　學院積極探索學院三個本科專業的互融互通“大類培養”，排名在本專業前50%的學生，大二下學期可申請在學院內調整同批次專業，在三個專業間自由轉專業。

　　學院旨在打造擁有本、碩、博完整培養層次、工程審計特色和優勢明顯的一流審計學院。傾力培養符合社會需要的具有深厚工程專業功底、扎實審計知識和大數據交叉學科特質的“工程+審計+計算機”復合型工程審計類高級人才，滿足社會各界的迫切需要。始終堅持服務國家經濟發展大局，促進政府投資和重大公共工程管理更加規范高效，服務國家治理體系和治理能力現代化。